穆世清,字济波,晚年自号孟然,清光绪二十一年(1895年)生于先市镇。光绪三十四年(1908年),在县高等小学堂读书时,受监督、同盟会员任大容教导,思想倾向革命。宣统三年(1911年)九月,任大容领导合江同志军起义,他在同志军司令部协助保管杂物。合江中学毕业后,考入成都高等师范。
民国7年(1918年)高师毕业后,在四川省立第一师范学校任教。其时李大钊、陈愚生等7人在北京筹建“少年中国学会”。8年6月15日,他与李劼人、孙少荆等9人在成都成立“少年中国学会成都分会”。创办《星期日》周刊,由李劼人任编辑。以后,由他接任。
民国10年(1921年),陈愚生在重庆联合进步人士举办夏令讲学会,他与少年中国学会会员邓中夏等七人应邀到重庆夏令讲学会讲学40天,宣传新文化运动。同年,受少年中国学会会员、川南师范校长王德熙聘请任该校国文教员。次年4月,永宁道尹公署教育科长卢作孚接受川南师范代理校长共产党人、少年中国学会会员恽代英的建议,在泸县白塔寺成立通俗讲习所。他与恽代英、肖楚女、李求实等人,每天晚上轮流去讲演所演说,宣传新思想。
民国12年(1923年),在南京东南大学任教授。15年,在西北大学任教授。同年,军阀混战,西安城被围。6月,学校被迫停课。7月,陕西、山西、甘肃等省在校学生成立“围城读书会”,他与吴芳吉教授共同担任辅导工作。
民国16年(1927年),在中山大学武昌分校任教。次年,出任南通中学校长。不久,得悉在黄埔军校政治部工作的共产党员、胞弟世济被反动派逮捕入狱。他赶赴广州营救,不幸世济已于7月7日在红花岗被杀害。他悲痛之余,将世济遗体安葬于广州东效四川义园。18年,卸南通中学校长职。此后,定居南京及西安。
民国27年(1938年)春,返回四川,在四川大学中文系任教授。当时川大招收新生,作文偏重文言文,轻视白语文。他与吴芳吉教授提倡文言文、白语文要同等重视,为学校采纳。28年至38年,先后在重庆四川省教育学院、四川省美术学院、中央政治学校任教授。其间,34年,在重庆南温泉创办私立草堂国学专科学校。35年下半年,返回合江任合江县私立之溪初中校长。曾与叶楚伦等人合篇中学《国文》课本。著有《中国文学史略》、《茧斋诗稿》。
解放后,任西南师范学院教授,四川省第一届人民代表大会代表,省政协委员,四川省图书馆副馆长,省文史馆研究员。1978年病逝于成都,享年83岁。