光绪元年（1875年），刑部尚书、奉天钦差、盛京将军文崇实奏调他任全营翼长，率兵剿貔子窝、大东沟各匪巢。马贼高希珍、木贼宋三好皆多年巨盗，数月荡平。升道员，加二品衔。不久，奉派总办东边边务。

　　东边地域，东滨鸭绿江，北缘长白山麓，长2000余里，宽100到400里不等。清初，以地接朝鲜，封禁派兵驻守。道光、咸丰以后，潜入开垦的增多。官吏藉以获取私利。而盗匪也多藏身其地。文崇实奏准解除封禁，委派其负责开辟。他分段丈量地亩，招民开垦种植，先后四年开垦土地180余万亩。厘定税则，征收赋税，年收入银10余万两。请准于鸭绿江上游设通化、怀仁二县，改兴京通判为直隶厅，辖二县；于下游设安东、宽甸二县，改由岩厅为州，设凤凰直隶厅统辖，另于龙冈以北设海龙厅。因地域辽阔，又于柳树河、长甸置两县丞；于帽儿山、通沟口、四平街、二龙渡、赛马集、大孤儿山置六巡查，以分为防。厅州县　统辖于道。光绪四年（1878年）清廷授他东边兵备道道员。

　　其时，帝俄侵入珲春以北地区，日本窥视朝鲜，边防极为重要。他周密规划，为久远之谋。修建城垣衙署，增筑营垒，建立马兵、步兵五营，分布巡辑，以为水陆之备。此外，建立学宫、书院，延师教授，购经史子集书籍一万余卷存书院，供学子阅读。

　　为防止帝俄侵略，他条陈黑龙江边防事宜，请募兵屯田，以为防备。对朝鲜情势尤为注意侦察，光绪六年（1880年）上《预筹保护东藩疏》，详陈防备日本侵略朝鲜策略。光绪八年六月初九日，朝鲜退隐的大院君李昰应果然煽动汉城兵民烧毁日本公使馆。日本派兵侵略朝鲜，胁迫朝鲜订立《济物甫条约》，获得驻兵朝鲜特权。

　　光绪八年（1882年）八月，北洋大臣拟与朝鲜改定陆路通商章程，盛京将军崇绮委派其办理。他与朝鲜专使渔允中会商于安东县九连城。允中依附日本，甚为傲慢。他面斥其不应叛国负恩。允中惶愧，所议得力持大体。议成上报，于八月二十日中朝订立《水陆通商章程》，委派其为边地通商监督。

　　以前边地与朝鲜通商，每年以二月、八月为期，每次通商约三个月，由盛京五部司员督理，税款多被侵吞，收入仅三千余两。光绪八年十一月，按新章程通商，一月即解户部税银一万数千两。此时，本植受诬陷，遭纠劾，清廷派员查办。后虽查明所劾均属虚诳，但他巳于冬初患病咯血，受此冤枉，忧愤交集，病情剧增，于十二月去世。光绪十五年，其子光弼遵父遗命，捐银2500两生息，作合江凤仪书院山长修敬、生童考课膏火附奖及生员乡试的试卷费。